I. Háziállatok archeogenetikai kutatása
I. Háziállatok archeogenetikai kutatása
Doktori iskola: Eötvös Loránd Tudományegyetem, Természettudományi Kar, Biológia Doktori Iskola, Genetika Doktori Program
Témavezető: Szécsényi-Nagy Anna, PhD
Helyszín: HUN-REN Bölcsészettudományi Kutatóközpont, Archeogenomikai Intézet (BTK AGI) (Budapest, 1097 Tóth Kálmán utca 4.)
Jelentkezési határidő: 2024. június
Háziállatok archeogenetikai kutatásában igen sok lehetőség rejlik. Ilyen a háziasítás és tenyésztés során lezajló mikroevolúciós és szelekciós folyamatok feltárása, az emberek és állatok viszonyának pontosabb megismerése. Háziállatok közül például a lovak biorégészeti kutatása kiemelkedő szerepet kapott és kap a tudományterületen, köszönhetően a lovak változatos szerepének és az emberekhez fűződő szoros viszonyuknak.
A hallgató feladata a populációgenetikai, filogenetikai és archeogenomikai elemzések elsajátítása, és alkalmazása háziállatok maradványaiból kinyert genomokon, továbbá a projekt céljainak eléréséhez szükséges statisztikai megoldások fejlesztése. A tervezett archeogenomikai elemzéseket a munkacsoport régész és archeozoológus szakértői fogják támogatni, a munka laboratóriumi részét pedig az Archeogenomikai Intézet asszisztensei végzik. A kutatáshoz az infrastruktúrát a HUN-REN BTK Archeogenomikai Intézetének laboratóriuma biztosítja. A lovak mellett több más háziállat (mint például teve) kutatása is bekapcsolható a PhD témába. A kutatás tematikáját és anyagi hátterét az MTA-BTK Lendület Biorégészet Program adja.
A PhD munkához bioinformatikai és Linux operációs rendszer alapismeretekre, R vagy Python programozási alapismeretekre van szükség.
Szükséges nyelvtudás: angol
További követelmények: biológus, biomérnök, fizikus vagy biofizikus végzettség (MSc), bioinformatikai alapismeretek
A programra felvehető diákok száma: 1
II. Archaikus minták teljes genomi elemzéseinek fejlesztése
Doktori iskola: Eötvös Loránd Tudományegyetem, Természettudományi Kar, Biológia Doktori Iskola, Genetika Doktori Program
Témavezető: Szécsényi-Nagy Anna, PhD
Helyszín: HUN-REN Bölcsészettudományi Kutatóközpont, Archeogenomikai Intézet (BTK AGI) (Budapest, 1097 Tóth Kálmán utca 4.)
Jelentkezési határidő: 2024. június
Az archeogenetika tudományterületén belül napjainkban egyre hangsúlyosabb szerepet kap a bioinformatika, az archaikus genomi adatok különböző feldolgozási lehetőségeinek fejlesztése.
Az Archaeogenomikai Intézet kutatócsoportja a közelmúltban kifejlesztett egy nyers DNS adatok feldolgozására szolgáló informatikai rendszert, olyan kapcsolódó eszközökkel, amelyek például monitorozzák a minták tisztaságát, vagy segítik az öröklődő betegségek és a fenotípushoz kapcsolható genetikai markerek nyomon követését (Gerber et al. 2023). A jelen PhD kutatás központi témája az ősi genomok mélyebb elemzéséhez hasznos további módszerek tesztelése, adaptálása és fejlesztése. A doktori munka egyik lehetséges iránya a populációgenetikai, a másik pedig a genetikai betegségek és egyes genomi régiók genetikai szelekciójának kutatása ősi populációkban.
A kutatás egyik központi témája a gépi tanulás lehetőségeinek és alkalmazásának felderítése az archaeogenetikai kutatásokban, így informatikai érdeklődést és erős statisztikai alapokat kíván.
A PhD munkához bioinformatikai és Linux operációs rendszer alapismeretekre, R vagy Python programozási alapismeretekre van szükség.
A kutatáshoz az infrastruktúrát az BTK Archeogenomikai Intézetének laboratóriuma biztosítja.
Szükséges nyelvtudás: angol
További követelmények: biológus, biomérnök, fizikus vagy biofizikus végzettség (MSc), bioinformatikai alapismeretek, Linux operációs rendszer ismeretek, alapvető programozási és biostatisztikai ismeretek
A programra felvehető diákok száma: 1
