+36 1 224 6781   

mtakk logo

Archeogenomikai Intézet

Gerber Dániel

Gerber Dániel

Gerber Dániel
Dániel Gerber

Tudományos munkatárs, Doktorandusz
Bioinformatikus, Molekuláris biológus

 

Intézeti szoba: K2.11.

Telefon: (+36 1) 2246700/4508

Email:

Research fellow, PhD student
Bioinformatician, Molecular biologist

 

Room: K2.11.

Phone: (+36 1) 2246700/4508

Email:

ÉvIntézményVégzettség, minősítés
2017- Eötvös Loránd Tudományegyetem (ELTE) Természettudományi  Kar Genetikai Tanszék doktorandusz
2014-2016 Szegedi Tudományegyetem (SZTE) Természettudományi és   Informatikai Kar Biológia  Intézet, Molekuláris- Immun és   Mikrobiológia szakirány biológus, MSc
2009-2014 Pécsi Tudományegyetem (PTE) Természettudományi kar, Biológiai Intézet, Szupraindividuális szakirány biológus, BSc
YearInstituteDegree, qualification 
2017- Eötvös Loránd University, Faculty of Science, Doctoral School of Biology PhD student
2014-2016 University of Szeged, Faculty of Science and Informatics Biologist, MSc
2009-2014 University of Pécs, Faculty of Science Biology, BSc
ÉvIntézményBeosztás
2021- ELKH BTK Archeogenomikai Intézet tudományos munkatárs
2019- AMIS Laboratory, Université de Toulouse III, Franciaország EMBO gyakornok
2016-2021 MTA BTK Régészeti Intézet (2019-től jogutódja BTK Régészeti Intézet) tudományos segédmunkatárs
2013 Ecological Genetics Research Unit (EGRU), Helsingin Yliopisto, Finnország  Erasmus+ gyakornok/laborasszisztens
YearInstitutePosition
2021- RCH Institute of Archaeogenomics Research fellow
2019- AMIS Laboratory, Université de Toulouse III, France EMBO assistant
2016-2021 HAS RCH Institute of Archaeology Assistant research fellow
2013 ERASMUS intern, Ecological Genetics Research Unit, University of Helsinki Erasmus+
Laboratory assistant
Kutatási terület:
  1. Bioinformatikai és biostatisztikai módszertan használata és fejlesztése (equida-capture fejlesztés, kiértékelés automatizáció és optimalizáció) az archeogenetikába
  2. Humán és nonhumán populációgenomika
  3. Filogenetikai/filogenomikai analízis
  4. Tárgy-archeogenetika: szerves anyagok, pl. elefántcsontból készült játékbábuk archeogenetikai vizsgálata
  5. Humán arcrekonstrukció és fenotípusvizsgálat
  6. Bazídiumos gombák korai evolúciójának filogenomikai analízise
  7. Röpképtelenség evolúciójának tanulmányozása dél-amerikai terrormadár modelleken

 

Pályázati tevékenység
Futamidő TémaTámogató Megbízatás
2020-2025 Integrating genetic, archaeological and historical perspectives on Eastern Central Europe, 400-900 AD (HistoGenes ERC  résztvevő kutató
2013- A Kárpát-medence késő rézkori temetkezéseinek komplex elemzése NKFIH résztvevő kutató
2015-2020 Csontoktól, bronzoktól és telepektől a társadalomig: vándorlások és társadalmi változások multidiszciplináris kutatása a bronzkori Magyarországon (Kr. e. 2500-1500) MTA Lendület  résztvevő kutató
2018-2023 Árpád-ház Program V.1. részprojekt: Árpád-kori magyarság embertani-genetikai képe 39509/2018/KFSZ  résztvevő
Research interest:
  1. Human and non-human population genomics
  2. Phylogenetics/phylogenomics
  3. Artifact-archaeogenetics: analyses of organic material, e.g. ivory board game pieces
  4. Facial reconstruction and phenotype assessment
  5. Early evolution of Basidiomycota
  6. Evolution of flightlessness based on South American terror-bird models

 

Research projects

Term

 Project title

 Supporter

 Role

2020-2025

Integrating genetic, archaeological and historical perspectives on Eastern Central Europe, 400-900 AD (HistoGenes)

 ERC 

participant researcher

2013-

Complex analysis of late copper age burials of the Carpathian Basin

 NKFIH

participant researcher

2015-2020

From bones, bronze and colonies to society: multidisciplinary research of migration and social change in Bronze Age Hungary (Cr. 2500-1500)

HAS Momentum (MTA Lendület) 

participant researcher

2018-2023

Árpád dynasty program: The anthropological and genetic composition of the Árpád Age Hungarian population (V.1 subproject)

 39509/2018/KFSZ 

participant

 

ÉvEgyesületMegbízatás
2018- EAA (European Association of Archaeologists) tag
Year Association Mandate
2018- EAA (European Association of Archaeologists) membership
Válogatott bibliográfia
1

Pablo Librado, Naveed Khan, Antoine Fages, Mariya A. Kusliy, Tomasz Suchan, Laure Tonasso-Calvière, Stéphanie Schiavinato, Duha Alioglu, Aurore Fromentier, Aude Perdereau, Jean-Marc Aury, Charleen Gaunitz, Lorelei Chauvey, Andaine Seguin-Orlando, Clio Der Sarkissian, John Southon, Beth Shapiro, Alexey A. Tishkin, Alexey A. Kovalev, Saleh Alquraishi, Ahmed H. Alfarhan, Khaled A. S. Al-Rasheid, Timo Seregély, Lutz Klassen, Rune Iversen, Olivier Bignon-Lau, Pierre Bodu, Monique Olive, Jean-Christophe Castel, Myriam Boudadi-Maligne, Nadir Alvarez, Mietje Germonpré, Magdalena Moskal-del Hoyo, Jarosław Wilczyński, Sylwia Pospuła, Anna Lasota-Kuś, Krzysztof Tunia, Marek Nowak, Eve Rannamäe, Urmas Saarma, Gennady Boeskorov, Lembi Lōugas, René Kyselý, Lubomír Peške, Adrian Bălășescu, Valentin Dumitrașcu, Roxana Dobrescu, Daniel Gerber, Viktória Kiss, Anna Szécsényi-Nagy, Balázs G. Mende, Zsolt Gallina, Krisztina Somogyi, Gabriella Kulcsár, Erika Gál, Robin Bendrey, Morten E. Allentoft, Ghenadie Sirbu, Valentin Dergachev, Henry Shephard, Noémie Tomadini, Sandrine Grouard, Aleksei Kasparov, Alexander E. Basilyan, Mikhail A. Anisimov, Pavel A. Nikolskiy, Elena Y. Pavlova, Vladimir Pitulko, Gottfried Brem, Barbara Wallner, Christoph Schwall, Marcel Keller, Keiko Kitagawa, Alexander N. Bessudnov, Alexander Bessudnov, William Taylor, Jérome Magail, Jamiyan-Ombo Gantulga, Jamsranjav Bayarsaikhan, Diimaajav Erdenebaatar, Kubatbeek Tabaldiev, Enkhbayar Mijiddorj, Bazartseren Boldgiv, Turbat Tsagaan, Mélanie Pruvost, Sandra Olsen, Cheryl A. Makarewicz, Silvia Valenzuela Lamas, Silvia Albizuri Canadell, Ariadna Nieto Espinet, Ma Pilar Iborra, Jaime Lira Garrido, Esther Rodríguez González, Sebastián Celestino, Carmen Olària, Juan Luis Arsuaga, Nadiia Kotova, Alexander Pryor, Pam Crabtree, Rinat Zhumatayev, Abdesh Toleubaev, Nina L. Morgunova, Tatiana Kuznetsova, David Lordkipanize, Matilde Marzullo, Ornella Prato, Giovanna Bagnasco Gianni, Umberto Tecchiati, Benoit Clavel, Sébastien Lepetz, Hossein Davoudi, Marjan Mashkour, Natalia Ya. Berezina, Philipp W. Stockhammer, Johannes Krause, Wolfgang Haak, Arturo Morales-Muñiz, Norbert Benecke, Michael Hofreiter, Arne Ludwig, Alexander S. Graphodatsky, Joris Peters, Kirill Yu. Kiryushin, Tumur-Ochir Iderkhangai, Nikolay A. Bokovenko, Sergey K. Vasiliev, Nikolai N. Seregin, Konstantin V. Chugunov, Natalya A. Plasteeva, Gennady F. Baryshnikov, Ekaterina Petrova, Mikhail Sablin, Elina Ananyevskaya, Andrey Logvin, Irina Shevnina, Victor Logvin, Saule Kalieva, Valeriy Loman, Igor Kukushkin, Ilya Merz, Victor Merz, Sergazy Sakenov, Victor Varfolomeyev, Emma Usmanova, Viktor Zaibert, Benjamin Arbuckle, Andrey B. Belinskiy, Alexej Kalmykov, Sabine Reinhold, Svend Hansen, Aleksandr I. Yudin, Alekandr A. Vybornov, Andrey Epimakhov, Natalia S. Berezina, Natalia Roslyakova, Pavel A. Kosintsev, Pavel F. Kuznetsov, David Anthony, Guus J. Kroonen, Kristian Kristiansen, Patrick Wincker, Alan Outram & Ludovic Orlando: The origins and spread of domestic horses from the Western Eurasian steppes. Nature (2021). https://doi.org/10.1038/s41586-021-04018-9

2

Csáky, Veronika ; Gerber, Dániel ; Szeifert, Bea ; Egyed, Balázs ; Stégmár, Balázs ; Botalov, SergeiCsáky, Veronika ; Gerber, Dániel ; Szeifert, Bea ; Egyed, Balázs ; Stégmár, Balázs ; Botalov, SergeiGennad’evich ; Grudochko, Ivan Valer’evich ; Matveeva, Natalia Petrovna ; Zelenkov, AlexanderSergejevich ; Sleptsova, Anastasiia Viktorovna et al.Early medieval genetic data from Ural region evaluated in the light of archaeological evidence ofancient HungariansSCIENTIFIC REPORTS 10 : 1 Paper: 19137 (2020)
3 Gerber, Dániel ; Székely, Orsolya ; Szeifert, Bea ; Egyed, Balázs ; Ari, Eszter ; Köhler, Kitti ; Mende,Gerber, Dániel ; Székely, Orsolya ; Szeifert, Bea ; Egyed, Balázs ; Ari, Eszter ; Köhler, Kitti ; Mende,Balázs Gusztáv ; Fábián, Szilvia ; Kiss, Viktória ; Szécsényi-Nagy, AnnaInferences on origin and social organisation of early and middle bronze age communities livedin the western Carpathian BasinIn: Kleinová, Kateřina (szerk.) 26th EAA Virtual Annual Meeting: Abstract BookPrága, Csehország : European Association of Archaeologists (2020) 575 p. p. 1
4 Veronika, Csáky ✉ ; Dániel, Gerber ; István, Koncz ; Gergely, Csiky ; Balázs, G. Mende ;  Bea,Szeifert ; Balázs, Egyed ; Horolma, Pamjav ; Antónia, Marcsik ; Erika, Molnár et al.Genetic insights into the social organisation of the Avar period elite in the 7th century ADCarpathian BasinSCIENTIFIC REPORTS 10 : 1 Paper: 948 , 14 p. (2020)
5 Arun, N Prasanna ; Daniel, Gerber ; Teeratas, Kijpornyongpan ; M, Catherine Aime ; Vinson, PArun, N Prasanna ; Daniel, Gerber ; Teeratas, Kijpornyongpan ; M, Catherine Aime ; Vinson, PDoyle ; Laszlo, G NagyModel Choice, Missing Data, and Taxon Sampling Impact Phylogenomic Inference of DeepBasidiomycota RelationshipsSYSTEMATIC BIOLOGY 2019 : 07 May 2019 Paper: syz029 (2019)
6 Gerber, D ; Koncz, I ; Tóth, Zs ; Szécsényi-Nagy, A ; Mende, BGGerber, D ; Koncz, I ; Tóth, Zs ; Szécsényi-Nagy, A ; Mende, BGThe Complex Approaches of Artefact-ArchaeogeneticsIn: Kateřina, Kleinová (szerk.) 24th EAA Annual Meeting : Re?ecting Futures. Barcelona, 5-8September 2018. : Abstract book Barcelona, Spanyolország : Universidad de Barcelona, European Association of Archaeologists,(2018) p. 269
A teljes bibliográfia és az egyes tanulmányokra való független hivatkozások a Magyar Tudományos Akadémia honlapján található MTMT Adatbázisban  tekinthetők meg.

 

 

Selected publications
1 Pablo Librado, Naveed Khan, Antoine Fages, Mariya A. Kusliy, Tomasz Suchan, Laure Tonasso-Calvière, Stéphanie Schiavinato, Duha Alioglu, Aurore Fromentier, Aude Perdereau, Jean-Marc Aury, Charleen Gaunitz, Lorelei Chauvey, Andaine Seguin-Orlando, Clio Der Sarkissian, John Southon, Beth Shapiro, Alexey A. Tishkin, Alexey A. Kovalev, Saleh Alquraishi, Ahmed H. Alfarhan, Khaled A. S. Al-Rasheid, Timo Seregély, Lutz Klassen, Rune Iversen, Olivier Bignon-Lau, Pierre Bodu, Monique Olive, Jean-Christophe Castel, Myriam Boudadi-Maligne, Nadir Alvarez, Mietje Germonpré, Magdalena Moskal-del Hoyo, Jarosław Wilczyński, Sylwia Pospuła, Anna Lasota-Kuś, Krzysztof Tunia, Marek Nowak, Eve Rannamäe, Urmas Saarma, Gennady Boeskorov, Lembi Lōugas, René Kyselý, Lubomír Peške, Adrian Bălășescu, Valentin Dumitrașcu, Roxana Dobrescu, Daniel Gerber, Viktória Kiss, Anna Szécsényi-Nagy, Balázs G. Mende, Zsolt Gallina, Krisztina Somogyi, Gabriella Kulcsár, Erika Gál, Robin Bendrey, Morten E. Allentoft, Ghenadie Sirbu, Valentin Dergachev, Henry Shephard, Noémie Tomadini, Sandrine Grouard, Aleksei Kasparov, Alexander E. Basilyan, Mikhail A. Anisimov, Pavel A. Nikolskiy, Elena Y. Pavlova, Vladimir Pitulko, Gottfried Brem, Barbara Wallner, Christoph Schwall, Marcel Keller, Keiko Kitagawa, Alexander N. Bessudnov, Alexander Bessudnov, William Taylor, Jérome Magail, Jamiyan-Ombo Gantulga, Jamsranjav Bayarsaikhan, Diimaajav Erdenebaatar, Kubatbeek Tabaldiev, Enkhbayar Mijiddorj, Bazartseren Boldgiv, Turbat Tsagaan, Mélanie Pruvost, Sandra Olsen, Cheryl A. Makarewicz, Silvia Valenzuela Lamas, Silvia Albizuri Canadell, Ariadna Nieto Espinet, Ma Pilar Iborra, Jaime Lira Garrido, Esther Rodríguez González, Sebastián Celestino, Carmen Olària, Juan Luis Arsuaga, Nadiia Kotova, Alexander Pryor, Pam Crabtree, Rinat Zhumatayev, Abdesh Toleubaev, Nina L. Morgunova, Tatiana Kuznetsova, David Lordkipanize, Matilde Marzullo, Ornella Prato, Giovanna Bagnasco Gianni, Umberto Tecchiati, Benoit Clavel, Sébastien Lepetz, Hossein Davoudi, Marjan Mashkour, Natalia Ya. Berezina, Philipp W. Stockhammer, Johannes Krause, Wolfgang Haak, Arturo Morales-Muñiz, Norbert Benecke, Michael Hofreiter, Arne Ludwig, Alexander S. Graphodatsky, Joris Peters, Kirill Yu. Kiryushin, Tumur-Ochir Iderkhangai, Nikolay A. Bokovenko, Sergey K. Vasiliev, Nikolai N. Seregin, Konstantin V. Chugunov, Natalya A. Plasteeva, Gennady F. Baryshnikov, Ekaterina Petrova, Mikhail Sablin, Elina Ananyevskaya, Andrey Logvin, Irina Shevnina, Victor Logvin, Saule Kalieva, Valeriy Loman, Igor Kukushkin, Ilya Merz, Victor Merz, Sergazy Sakenov, Victor Varfolomeyev, Emma Usmanova, Viktor Zaibert, Benjamin Arbuckle, Andrey B. Belinskiy, Alexej Kalmykov, Sabine Reinhold, Svend Hansen, Aleksandr I. Yudin, Alekandr A. Vybornov, Andrey Epimakhov, Natalia S. Berezina, Natalia Roslyakova, Pavel A. Kosintsev, Pavel F. Kuznetsov, David Anthony, Guus J. Kroonen, Kristian Kristiansen, Patrick Wincker, Alan Outram & Ludovic Orlando: The origins and spread of domestic horses from the Western Eurasian steppes. Nature (2021). https://doi.org/10.1038/s41586-021-04018-9

2

Csáky, Veronika ; Gerber, Dániel ; Szeifert, Bea ; Egyed, Balázs ; Stégmár, Balázs ; Botalov, SergeiCsáky, Veronika ; Gerber, Dániel ; Szeifert, Bea ; Egyed, Balázs ; Stégmár, Balázs ; Botalov, SergeiGennad’evich ; Grudochko, Ivan Valer’evich ; Matveeva, Natalia Petrovna ; Zelenkov, AlexanderSergejevich ; Sleptsova, Anastasiia Viktorovna et al.Early medieval genetic data from Ural region evaluated in the light of archaeological evidence ofancient Hungarians SCIENTIFIC REPORTS 10 : 1 Paper: 19137 (2020)
3 Gerber, Dániel ; Székely, Orsolya ; Szeifert, Bea ; Egyed, Balázs ; Ari, Eszter ; Köhler, Kitti ; Mende,Gerber, Dániel ; Székely, Orsolya ; Szeifert, Bea ; Egyed, Balázs ; Ari, Eszter ; Köhler, Kitti ; Mende,Balázs Gusztáv ; Fábián, Szilvia ; Kiss, Viktória ; Szécsényi-Nagy, AnnaInferences on origin and social organisation of early and middle bronze age communities livedin the western Carpathian BasinIn: Kleinová, Kateřina (szerk.) 26th EAA Virtual Annual Meeting: Abstract BookPrága, Csehország : European Association of Archaeologists (2020) 575 p. p. 1
4 Veronika, Csáky ✉ ; Dániel, Gerber ; István, Koncz ; Gergely, Csiky ; Balázs, G. Mende ;  Bea,Szeifert ; Balázs, Egyed ; Horolma, Pamjav ; Antónia, Marcsik ; Erika, Molnár et al.Genetic insights into the social organisation of the Avar period elite in the 7th century ADCarpathian BasinSCIENTIFIC REPORTS 10 : 1 Paper: 948 , 14 p. (2020)
5 Arun, N Prasanna ; Daniel, Gerber ; Teeratas, Kijpornyongpan ; M, Catherine Aime ; Vinson, PArun, N Prasanna ; Daniel, Gerber ; Teeratas, Kijpornyongpan ; M, Catherine Aime ; Vinson, PDoyle ; Laszlo, G NagyModel Choice, Missing Data, and Taxon Sampling Impact Phylogenomic Inference of DeepBasidiomycota RelationshipsSYSTEMATIC BIOLOGY 2019 : 07 May 2019 Paper: syz029 (2019)
6 Gerber, D ; Koncz, I ; Tóth, Zs ; Szécsényi-Nagy, A ; Mende, BGGerber, D ; Koncz, I ; Tóth, Zs ; Szécsényi-Nagy, A ; Mende, BGThe Complex Approaches of Artefact-ArchaeogeneticsIn: Kateřina, Kleinová (szerk.) 24th EAA Annual Meeting : Re?ecting Futures. Barcelona, 5-8September 2018. : Abstract book Barcelona, Spanyolország : Universidad de Barcelona, European Association of Archaeologists,(2018) p. 269

The whole bibliography is available from MTMT database of HAS.

 

 

Év Díj megnevezése
2019 EMBO short term fellowship szakmai gyakorlat, Franciaország, 6 hónap
2013

ERASMUS+ külföldi szakmai gyakorlat, Finnország, 3 hónap

Year Awards
2019 EMBO short term fellowship, Toulouse, France, 6 months
2013

ERASMUS+ internship, Finland, 3 months

Kapcsolat

Cím

1097 Budapest
Tóth Kálmán utca 4.

Telefon

+36 1 224 6781

E-mail